本发明公开了一种蛋白质无标绝对定量方法,其步骤包括:1)从筛选出的高可信蛋白质中选取出若干肽段作为高可信肽段,计算每一高可信肽段的物理化学性质及肽段定量效率;2)基于高可信肽段的物理化学性质和肽段定量效率,构建训练集;然后利用该训练集训练得到肽段定量效率预测模型;3)利用所述肽段定量效率预测模型预测鉴定蛋白质的各鉴定肽段的肽段定量效率;4)根据鉴定蛋白的各鉴定肽段的原始质谱信号强度和对应肽段定量效率计算该鉴定蛋白质的定量值;5)根据标准蛋白质的已知浓度和定量值预测其他待测蛋白质的蛋白质浓度值。本发明从蛋白层面和肽段层面来考虑对质谱原始信号强度进行校正,从而探索更准确的蛋白质绝对定量方法。
院属单位：中国科学院数学与系统科学研究院
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