本发明公开了一种酶切概率辅助的肽段可检测性预测方法,其步骤包括:1)在所有鉴定蛋白中筛选高可信蛋白;2)构建酶切位点酶切概率预测模型训练集;3)训练酶切位点酶切概率预测模型;4)对所有高可信蛋白进行理论酶切,得到理论酶切肽段;5)预测所有理论酶切肽段的酶切概率;6)构建肽段可检测性训练集;7)训练肽段可检测性模型;8)预测其他蛋白的所有理论酶切肽段的肽段可检测性。本发明根据鸟枪法蛋白质组学流程的特点,在肽段可检测性预测过程中考虑的蛋白的酶解过程,显著提高了肽段可检测性预测的准确率。
院属单位:中国科学院数学与系统科学研究院
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