本发明涉及一种基于子集错误率估计的肽鉴定方法,其步骤包括:1)用质谱仪分析需要鉴定的肽样品以生成串联质谱;2)把所述串联质谱搜索包含目标肽序列的目标-诱饵蛋白质数据库,将得到的肽鉴定结果按照打分从高到低排序;3)给定打分阈值x,采用迁移FDR方法估计打分高于x的第k类肽鉴定子集的错误率FDRk(x);4)通过调整打分阈值x找到的x最小值,使得估计出的FDRk(x)小于给定的错误率控制水平α,所得打分高于x的第k类肽鉴定结果即为可以接受的可靠鉴定结果。本发明通过迁移FDR方法估计子集错误率,进而通过该子集错误率得到肽的可靠鉴定结果,具有更高的鉴定准确率。
院属单位：中国科学院数学与系统科学研究院
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