本发明涉及一种蛋白质组多重定量方法。它是利用酸性条件下二甲基化反应在肽段N末端氨基和肽段C末端赖氨酸侧链氨基上速率不同的性质,在酸、碱条件下先后实现肽段N末端和C末端的二甲基化标记。通过二甲基化标记试剂各种同位素形式有机组合实现肽段样品的多重标记。多重标记后的肽段一级谱质荷比完全相同,二级谱碎片离子的质荷比存在差异,提取相应二级谱碎片离子强度进行多重定量分析。该方法的优势在于:定量准确度高,精密度好,动态范围宽,可以同时实现六重蛋白质样品的同时定量分析,大大提高蛋白质定量分析的通量,节约分析时间。
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