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  • 基于多目标优化的蛋白质结构预测及其对接系统

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    简介: 该成果是一组计算机软件套件。由不具同源关系的氨基酸序列预测蛋白质的三维结构是计算生物学领域中的挑战之一。本系统应用一种基于共享信息素的并行蚁群优化算法(图1),在现有能量函数指导下,通过不同能量项之间的相互制约, 构建具有最低能量的蛋白质骨架结构。具 有了蛋白质结构的计算机预测能力后,该 系统无缝整合了蛋白质对接系统(图2), 能够实现蛋白质一蛋白质、蛋白质一配 体和蛋白质一肽段的计算机对接,为新药发现提供硅片(in silicon)上的干实验室 (dry lab)结果。以上成果获得中国国家 自然科学基金委的多次项目资助。
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    该成果是一组计算机软件套件。由不具同源关系的氨基酸序列预测蛋白质的三维结构是计算生物学领域中的挑战之一。本系统应用一种基于共享信息素的并行蚁群优化算法(图1),在现有能量函数指导下,通过不同能量项之间的相互制约, 构建具有最低能量的蛋白质骨架结构。具 有了蛋白质结构的计算机预测能力后,该 系统无缝整合了蛋白质对接系统(图2), 能够实现蛋白质一蛋白质、蛋白质一配 体和蛋白质一肽段的计算机对接,为新药发现提供硅片(in silicon)上的干实验室 (dry  lab)结果。以上成果获得中国国家 自然科学基金委的多次项目资助。

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